Hodnotenie:
Kniha je komplexným zdrojom informácií pre pracovníkov v oblasti výpočtovej biológie, pričom kladie dôraz najmä na praktické využitie jazyka Python v bioinformatike. Pokrýva rôzne témy vrátane sekvenovania novej generácie, populačnej genetiky a štruktúry proteínov, pričom ponúka príklady kódu a vysvetlenia. Vyžaduje si však strednú až vysokú znalosť jazyka Python a určitú znalosť bioinformatickej terminológie.
Výhody:⬤ Komplexné pokrytie rôznych oblastí výpočtovej biológie.
⬤ Poskytuje praktické rady pre programovanie v jazyku Python a príklady kódu.
⬤ Aktuálny a dobre štruktúrovaný obsah.
⬤ Jasná a stručná prezentácia materiálov.
⬤ Vhodné pre stredne pokročilých až pokročilých používateľov v oblasti bioinformatiky.
⬤ Vyžaduje predchádzajúce znalosti jazyka Python a terminológie bioinformatiky.
⬤ Nie je vhodný pre začiatočníkov v jazyku Python ani v bioinformatike.
⬤ Kapitolu 1 o inštalácii softvéru môžu niektorí používatelia s predchádzajúcimi znalosťami považovať za zbytočnú.
(na základe 6 čitateľských recenzií)
Bioinformatics with Python Cookbook
Naučte sa používať moderné bioinformatické knižnice a aplikácie jazyka Python na špičkový výskum v oblasti počítačovej biológie
O tejto knihe
Objavte a naučte sa používať najdôležitejšie knižnice a aplikácie jazyka Python na vykonávanie komplexných bioinformatických analýz Zameriava sa na najmodernejšie nástroje na vykonávanie výskumu so sekvenovaním novej generácie, genomikou, populačnou genetikou, fylogenomikou a proteomikou Využíva príklady z reálneho sveta a naučí vás implementovať vysoko účinné výskumné metódy
Pre koho je táto kniha určená
Ak máte stredne pokročilé znalosti jazyka Python a dobre poznáte hlavný výskum a slovnú zásobu v oblasti bioinformatiky, ktorá vás zaujíma, táto kniha vám pomôže ďalej rozvíjať vaše znalosti.
Čo sa naučíte
Získať hlboké pochopenie základných bioinformatických knižníc jazyka Python a zoznámiť sa s najdôležitejšími nástrojmi dátovej vedy v jazyku Python Spracovať údaje o celom genóme pomocou knižnice Biopython Analyzovať a vykonávať kontrolu kvality súborov údajov sekvenovania novej generácie pomocou knižníc, ako sú PyVCF alebo PySAM Používať DendroPy a Biopython na fylogenetickú analýzu Vykonávať populačno-genetickú analýzu na veľkých súboroch údajov Simulovať zložité demografické a genomické vlastnosti pomocou knižnice simuPOP
Podrobnejšie
Ak ste počítačový biológ alebo programátor Pythonu, pravdepodobne sa vám spája výraz „prudký rast, vzrušujúce časy“. Python je pravdepodobne hlavným programovacím jazykom pre veľké objemy údajov a záplava údajov v biológii, najmä z genomiky a proteomiky, robí z bioinformatiky jednu z najzaujímavejších oblastí dátovej vedy.
Pomocou praktických receptov v tejto knihe budete môcť robiť praktický výskum a analýzu v oblasti výpočtovej biológie pomocou jazyka Python. Venujeme sa moderným sekvenčným knižniciam novej generácie a skúmame reálne príklady, ako pracovať so skutočnými údajmi. V knihe sa zameriavame najmä na praktické využitie bioinformatiky, ale venujeme sa aj moderným programovacím technikám a rámcom na zvládnutie stále rastúcej záplavy bioinformatických údajov.
