p53's Versatility in DNA Binding Site Recognition
Proteín p53 je transkripčný faktor, ktorý zohráva kľúčovú úlohu pri udržiavaní stability genómu reguláciou expresie génov zapojených do kontroly bunkového cyklu, opravy DNA a apoptózy. Jednou z kľúčových funkcií p53 je rozpoznávanie a viazanie sa na špecifické sekvencie DNA v promótorových oblastiach cieľových génov.
Hoci je p53 najznámejší svojou schopnosťou viazať sa na konsenzuálnu sekvenciu DNA 5'-PuPuPuC(A/T)(T/A)GPyPyPy-3', v súčasnosti je jasné, že p53 sa môže viazať na širokú škálu sekvencií DNA s rôznou afinitou. Táto všestrannosť v rozpoznávaní väzbových miest DNA je spôsobená jedinečnou štruktúrou DNA-viažucej domény p53, ktorá obsahuje dve veľké slučky, ktoré môžu nadobúdať viaceré konformácie na interakciu s rôznymi sekvenciami DNA.
Štúdie ukázali, že schopnosť p53 rozpoznávať rôzne sekvencie DNA je rozhodujúca pre jeho funkciu nádorového supresora. V niektorých prípadoch môže schopnosť p53 viazať sa na nekonsenzuálne sekvencie DNA umožniť aktiváciu génov, ktoré nie sú zvyčajne regulované p53. To umožňuje p53 reagovať na širšie spektrum bunkových stresov vrátane oxidačného stresu, hypoxie a poškodenia DNA.
Okrem schopnosti viazať sa priamo na DNA môže p53 interagovať aj s inými proteínmi a regulovať tak expresiu génov. Napríklad p53 môže interagovať s komplexmi prestavby chromatínu, histón acetyltransferázami a inými transkripčnými faktormi, aby moduloval expresiu génov.
Celkovo možno povedať, že všestrannosť p53 pri rozpoznávaní väzbových miest DNA je kritickým aspektom jeho funkcie ako nádorového supresora. Rozpoznávaním rôznorodých sekvencií DNA môže p53 reagovať na širokú škálu bunkových stresov a regulovať expresiu génov podieľajúcich sa na udržiavaní genómovej stability.