Tkanivová fenomika: Profilovanie pacientov s rakovinou na účely rozhodovania o liečbe

Pôvodný názov:

Tissue Phenomics: Profiling Cancer Patients for Treatment Decisions

Obsah knihy:

V ére digitalizácie sa naša spoločnosť transformuje do nového stavu. Najmä strojová inteligencia dramaticky zvyšuje našu schopnosť vytvárať a spracovávať informácie.

Tento trend prirodzene ovplyvňuje aj zdravotníctvo, ktoré sa v budúcnosti ešte viac premení na disciplínu riadenú informatizáciou. V najdôležitejšej oblasti histopatológie, interpretácii tkanivových rezov od pacientov s rakovinou, bude mať informatika skorý a obrovský vplyv na rozhodnutia o liečbe a pravdepodobne bude pôsobiť ako vedúca disciplína tejto transformácie v medicíne. Tkanivová fenomika poskytuje komplexnú metodiku zameranú na objavenie čo najpresnejšieho algoritmu na podporu rozhodovania na základe tkanív prostredníctvom úzkej integrácie vývoja testov, analýzy obrazu a bioinformatiky a optimalizačných spätných slučiek.

V tejto knihe je opísaná metodika tkanivovej fenomiky a jej výhody a bohatstvo.

V jednotlivých kapitolách sú vysvetlené jednotlivé zložky tkanivovej fenomiky. V kapitolách 2 až 4 tejto knihy rôzni autori opisujú rôzne prístupy, ako premeniť množstvo pixelových údajov z tkanivových preparátov na informácie využiteľné na ťažbu pomocou metód analýzy obrazu založených na znalostiach a na údajoch.

Následne sa venujú datafikácii obrazov a bioinformatickej časti, ktorá zohráva kľúčovú úlohu pri vytváraní prognostických a prediktívnych modelov vývoja ochorenia. Dôležitá je aj integrácia ďalších zdrojov údajov, ako sú genomika, rádiomika a informácie súvisiace s pacientom, ktoré sú tiež opísané. Ako sa uvádza v kapitolách 5 a 6, tieto modely môžu klasifikovať pacientov do odlišných skupín, napríklad tých, ktorí reagujú na danú liečbu.

Keďže tkanivová fenomika poskytuje obrovský súbor potenciálne prognostických znakov (fénov), jedným zo zameraní oboch kapitol sú robustné metódy výberu znakov pomocou pokročilých Monte-Carlo krížových validačných algoritmov. V 7. kapitole rozoberáme viaceré príklady použitia tkanivovej fenomiky v akademickom a komerčnom prostredí a jej obrovský vplyv na pokrok v biomedicínskych vedách.

V nadväznosti na úspechy vo výskume sa v kapitolách 8 a 9 rozoberajú aplikácie v klinickom prostredí a v kapitole 10 poskytujeme príchuť do budúcnosti, ktorú si predstavujeme v kapitole 10. Tkanivová dataprojekcia a následné profilovanie pacienta je súčasťou každého rutinného vyšetrenia s cieľom čo najlepšie priradiť pacientom najúspešnejšiu terapiu podľa predpovede tkanivových fénov.