Systémová analýza a integrácia veľkých omických údajov

Pôvodný názov:

Systems Analytics and Integration of Big Omics Data

Obsah knihy:

"Genotyp" je v podstate úplná dedičná informácia organizmu, ktorá sa získava od jeho rodičov. Fenotyp" sú skutočné pozorované fyzické a behaviorálne vlastnosti organizmu.

Tie môžu zahŕňať znaky, ako je morfológia, veľkosť, výška, farba očí, metabolizmus atď. Jednou z naliehavých výziev vo výpočtovej a systémovej biológii je predpovedanie genotypu na fenotyp. Je to náročné vzhľadom na množstvo údajov generovaných modernými omickými technológiami.

Tieto "veľké údaje" sú také veľké a komplexné, že tradičné aplikácie na spracovanie údajov túto úlohu nezvládajú. Výzvy vznikajú pri zbere, analýze, dolovaní, zdieľaní, prenose, vizualizácii, archivácii a integrácii týchto údajov.

V tomto osobitnom vydaní sa pozornosť venuje analýze omických údajov na systémovej úrovni, najnovšiemu vývoju v oblasti anotácie génovej ontológie a pokroku v oblasti biologických dráh a sieťovej biológie. Skúma sa integrácia omických údajov s klinickými a biomedicínskymi údajmi pomocou strojového učenia.

Toto osobitné vydanie sa zaoberá novými metodikami v kontexte interakcií medzi génmi a prostredím, expresie génov špecifických pre tkanivo a vplyvu vonkajších faktorov alebo genetiky hostiteľa na mikrobióm.