Synthetic Gene Circuits: Methods and Protocols
1. Kvalitatívne modelovanie, analýza a riadenie syntetických regulačných obvodov.
Madalena Chaves a Hidde de Jong.
2. Stochastické diferenciálne rovnice pre praktickú simuláciu génových obvodov.
Jesus Pico, Alejandro Vignoni a Yadira Boada.
3. Použitie modelov na (re)návrh syntetických obvodov.
Giselle McCallum a Laurent Potvin-Trottier.
4. Automatizovaný návrh biologických obvodov pomocou SYNBADm.
Irene Otero-Muras a Julio R. Banga.
5. Zriadenie automatizovaného laboratória na výrobu bioprvkov.
Marilene Pavan.
6. Počítačom podporovaný návrh a predbežná validácia veľkých dávok DNA zostáv.
Valentin Zulkower.
7. Počítačom podporované plánovanie na overovanie veľkých dávok DNA konštruktov.
Valentin Zulkower.
8. Charakterizácia genetických častí a zariadení pomocou sekvenovania RNA.
Deepti Vipin, Zoya Ignatova a Thomas E. Gorochowski.
9. Steady-State Cell-Free Gene Expression with Microfluidic Chemostats (Ustálená expresia génov bez buniek pomocou mikrofluidných chemostatov).
Nadanai Laohakunakorn, Barbora Lavičková, Zoe Swank, Julie Laurent a Sebastian J. Maerkl.
10. Platforma založená na mikrofluidoch a mikroskopii pre riadenú expresiu génov na čipe v bunkách cicavcov.
Mahmoud Khazim, Elisa Pedone, Lorena Postiglione, Diego di Bernardo a Lucia Marucci.
11. Optimálny experimentálny dizajn pre systémovú a syntetickú biológiu s použitím Amigo2.
Eva Balsa-Canto, Lucia Bandiera a Filippo Menolaschina.
12. Kyberfyzická platforma na kalibráciu modelov.
Lucia Bandiera, David Gomez Cabeza, Eva Balsa-Canto a Filippo Menolascina.
13. Predpovedanie bunkovej záťaže pomocou modelov hostiteľského obvodu.
Evangelos-Marios Nikolados, Andrea Y. Wei e a Diego A. Oyarz un.
14. Praktický návod krok za krokom na kvantifikáciu retroaktivity v génových sieťach.
Andras Gyorgy.
15. Inžinierske senzory pre zaťaženie expresie génov.
Alice Boo a Francesca Ceroni.
16. Inžinierstvo proteínových častí pre genetické zariadenia v bunkách cicavcov.
Giuliano Bonfa, Federica Cella a Velia Siciliano.