Skladanie proteínov: Metódy a protokoly

Pôvodný názov:

Protein Folding: Methods and Protocols

Obsah knihy:

1. Mutačná analýza prechodných stavov skladania proteínov: Hodnoty Phi.

Luis Alberto Campos.

2. Upravené miesta s väzbou kovov na skúmanie prechodových stavov pri skladaní proteínov: Psi analýza.

Michael Baxa, Tobin R. Sosnick.

3. Interrogation of Protein Structure and Stability (Výskum štruktúry a stability proteínov špecifických pre dané miesto).

Debopreeti Mukherjee, Ismail A. Ahmed a Feng Gai.

4. Purification and Handling of the Chaperonin GroEL (Purifikácia a manipulácia so šaperonínom GroEL).

Xiang Ye.

5. -Folding free energy surfaces from Differential Scanning Calorimetry (Povrchy voľnej energie pri skladaní z diferenciálnej skenovacej kalorimetrie).

Jose M. Sanchez-Ruiz a Beatriz Ibarra-Molero.

6. Kinetika rýchleho skladania pomocou metód teplotných skokov vyvolaných nanosekundovým laserom.

Michele Cerminara.

7. Meranie submilisekundového skladania proteínov pomocou fluorescencie Trp a fotochemickej oxidácie.

David Witalka a Lisa J. Lapidus.

8. Metódy výmeny vodíka v natívnom stave a hmotnostnej spektrometrie na skúmanie skladania a rozkladania proteínov.

Pooja Malhotra a Jayant B. Udgaonkar.

9. Multi-Probe Equilibrium Analysis of Gradual (Un)Folding Processes (Viacsondová rovnovážna analýza procesov postupného (ne)skladania).

Ginka S. Kubelka a Jan Kubelka.

10. Nmr analýza interakčných sietí pri skladaní proteínov.

Eva de Alba.

11. NMR Relaxačné disperzné metódy pre štrukturálnu a dynamickú analýzu rýchlo interkonvertujúcich, málo osídlených konformačných podstavov.

V. N. Sivanandam, Nicola D'Amelio a Victor Muoz.

12. Metódy výmeny vodíka v natívnom stave a hmotnostnej spektrometrie na skúmanie skladania a rozkladania proteínov.

Pooja Malhotra a Jayant B. Udgaonkar.

13. Single-Molecule Fluorescence Spectroscopy Approaches for Probing Fast Biomolecular Dynamics and Interactions (Prístupy jednomolekulovej fluorescenčnej spektroskopie na skúmanie rýchlej biomolekulovej dynamiky a interakcií).

Zifan Wang, Nivin Mothi a Victor Muoz.

14. Teória a analýza jednomolekulových FRET experimentov.

Irina V. Gopich a Hoi Sung Chung.

15. Mechanochemická evolúcia disulfidových väzieb v proteínoch.

Jrg Schnfelder, Alvaro Alonso-Caballero a Raul Perez-Jimenez.

16. Coarse-Grained Simulations of Protein Folding (Simulácie skladania proteínov s hrubým zrnom): Bridging Theory and Experiments.

Vincius G. Contessoto, Vincius M. Oliveira a Vitor B. P. Leite.

17. Analýza molekulovo-dymatických simulácií skladania proteínov.

Robert B. Best.

18. Atomistické simulácie tepelného rozkladania.

Angel E Garcia.

19. Molekulové simulácie vnútorne neusporiadaných proteínov a ich väzbových mechanizmov.

Xiakun Chu, Suhani Nagpal a Victor Muoz.

20. Predpovedanie rýchlosti skladania a rozkladania proteínov pomocou jednoduchých modelov.

David De Sancho a Victor Munoz.

21. Predpovedanie a simulácia mutačných účinkov na kinetiku skladania proteínov.

Athi N. Naganathan.

22 Lokalizácia energetickej frustrácie v proteínoch.

A. Brenda Guzovsky, Nicholas P. Schafer, Peter G. Wolynes a Diego U. Ferreiro.

23. Modelovanie štruktúry, dynamiky a transformácií proteínov pomocou silového poľa UNRES.

Adam K. Sieradzan, Cezary Czaplewski, P awel Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Agnieszka Karczyńska, Agnieszka Lipska, Emilia A. Lubecka, Ewa Golas, Tomasz Wirecki, Mariusz Makowski, Stanislaw Oldziej a Adam Liwo.