Rna-Seq Data Analysis: Praktický prístup

Recenzie čitateľov

Táto kniha je vysoko hodnotená pre svoj podrobný úvod do technológie RNAseq, vďaka čomu je ideálna pre začiatočníkov a učiteľov v oblasti bioinformatiky. Komplexne pokrýva praktické aplikácie, obsahuje pokyny pre príkazový riadok a poskytuje príklady z reálneho života, ktoré uľahčujú učenie. Niektorí používatelia však upozornili na problémy s dostupnosťou údajov z odporúčaných webových stránok a mali pocit, že niektoré technické aspekty, najmä tie, ktoré súvisia s R, sú nedostatočne zastúpené.

⬤ Vysoko praktické a komplexné
⬤ vynikajúce pre začiatočníkov
⬤ obsahuje pokyny krok za krokom a príklady z reálneho života
⬤ dobré na výučbu
⬤ samostatné a zahŕňa rôzne nástroje a metódy RNAseq.

⬤ K niektorým dátovým súborom sa nedalo dostať
⬤ nemusí pokrývať všetky relevantné nástroje
⬤ nedostatočne zastúpená časť o R
⬤ viac orientovaná na bioinformatikov ako na vedcov z mokrých laboratórií.

(na základe 15 čitateľských recenzií)

Pôvodný názov:

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Obsah knihy:

Súčasný stav v analýze transkriptómu Údaje zo sekvenovania RNA (RNA-seq) ponúkajú bezprecedentné informácie o transkriptóme, ale využitie týchto informácií pomocou bioinformatických nástrojov je zvyčajne úzkym miestom. Analýza údajov RNA-seq: Praktický prístup umožňuje výskumníkom skúmať rozdielnu expresiu na úrovni génov, exónov a transkriptov a objavovať nové gény, transkripty a celé transkriptómy.

Vyvážené pokrytie teórie a praxe Každá kapitola sa začína teoretickým pozadím, po ktorom nasleduje opis príslušných analytických nástrojov a praktické príklady. Príklady, ktoré sú prístupné bioinformatikom aj neprogramujúcim vedcom z mokrých laboratórií, ilustrujú používanie nástrojov príkazového riadku, R a iných nástrojov s otvoreným zdrojovým kódom, ako je napríklad grafický softvér Chipster.

Nástroje a metódy na začiatok práce vo vašom laboratóriu Táto samostatná príručka, ktorá čitateľov prevedie celým pracovným postupom analýzy údajov, poskytuje podrobný prehľad hlavných metód analýzy údajov RNA-seq a vysvetľuje, ako ich používať v praxi. Je vhodná pre výskumníkov z rôznych oblastí vrátane biológie, medicíny, genetiky a informatiky. Kniha sa dá použiť aj v rámci postgraduálneho alebo pokročilého bakalárskeho kurzu.