Od postupností ku grafom: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics (Diskrétne metódy a štruktúry pre bioinformatiku)

Pôvodný názov:

From Sequences to Graphs: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics

Obsah knihy:

Aby vedci mohli študovať živé organizmy, skúmajú ich nielen v celkovej makroskopickej mierke, ale aj v podrobnejšej mikroskopickej mierke. Toto pozorovanie, dotiahnuté do krajnosti, spočíva v skúmaní samotného stredu každej bunky, kde sa nachádzajú molekuly, ktoré určujú jej fungovanie: DNA (deoxyribonukleová kyselina) a RNA (ribonukleová kyselina).

V organizme nesie DNA genetickú informáciu, ktorá sa nazýva genóm. Je reprezentovaná ako štvorpísmenová sekvencia pomocou písmen A, C, G a T.

Na základe týchto sekvencií môžu počítačové metódy opísané v tejto knihe odpovedať na základné otázky bioinformatiky.

Táto kniha skúma, ako rýchlo nájsť sekvencie niekoľkých stoviek nukleotidov v genóme, ktorý môže pozostávať z niekoľkých miliárd, ako tieto sekvencie porovnať a ako zrekonštruovať kompletnú sekvenciu genómu. Rozoberá aj problémy identifikácie baktérií v danom prostredí a predpovedanie štruktúry RNA na základe jej sekvencie.