Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille

Obsah knihy:

V tejto práci je použitý in silico prístup na identifikáciu a charakterizáciu miRNA zachovaných v expresných sekvenčných značkách (EST) šošovice. Na identifikáciu nových miRNA v šošovici sa v sekvenciách EST hľadala homológia so známymi zrelými miRNA z rastlinnej ríše Viridiplantae pomocou online BLASTN.

Výpočtová identifikácia založená na komparatívnej genomike priniesla 12 potenciálnych kandidátov na miRNA patriacich do 12 rôznych rodín miRNA v šošovke. Nakoniec sa pomocou potenciálnych miRNA v šošovke predpovedalo celkovo 25 cieľových génov a znázornili sa ich pravdepodobné funkcie.

Zdá sa, že väčšina cieľových génov miRNA šošovky kóduje rast, vývoj, metabolizmus a reakciu na stres, odolnosť voči chorobám atď. V blízkej budúcnosti by lepšie pochopenie molekulárnych mechanizmov miRNA v rastline šošovice mohlo pomôcť pri vývoji novej a presnej techniky na pochopenie určitých mechanizmov posttranskripčného utlmovania génov v reakcii na toleranciu stresu.