Gerstein je strhujúci, skutočný príbeh Kurta Gersteina, excentrického mládežníckeho farára, ktorého náboženskú literatúru predávali desaťtisíce ľudí v celom prednacistickom Nemecku. Po prevzatí moci národnými socialistami v roku 1933 sa Gerstein takmer okamžite ocitá na ceste odporu voči nacistom a za protinacistické protesty je dvakrát uväznený. Po treťom uväznení cíti, že ho Boh povoláva, aby sa pridal k elitným jednotkám SS a stal sa, ako sám hovorí, "Božím špiónom" - prezývkou, ktorú si dal S ren Kierkegaard o storočie skôr.
Gerstein nastúpi na výcvik SS a prejde ním. Hoci si to Gerstein spočiatku neuvedomuje, vzhľadom na jeho pôvod a vzdelanie banského inžiniera v ňom velitelia SS vidia človeka, ktorý môže slúžiť národnosocialistickej veci. Následne sa ho veliteľ SS opýta, ako by sa čo najefektívnejšie preniesli jedovaté plyny do uzavretej miestnosti. Najskôr váha, ale potom je vyzvaný, aby odpovedal. Neskôr zistí, že jeho odpoveď vyriešila skorý mechanický problém v tom, čo nacisti uskutočnia ako "konečné riešenie" proti Židom.
V nasledujúcich rokoch Gerstein vytvára sabotážne akcie, aby zmaril vyhladzovanie Židov, a do svojich denníkov si zapisuje mnohé z toho, čo videl. Všetky podrobnosti o svojej práci "Božieho špióna" musí tajiť pred svojou manželkou zo strachu, že by ju vypočúvali kvôli informáciám. Nakoniec, ale neúspešne, varuje britské a americké veľvyslanectvo pred tým, čo sa deje v táboroch smrti. Dokonca vyjadrí znepokojenie aj vatikánskemu úradníkovi, ale bezvýsledne. Nikto neverí jeho príbehom o hrôze. Jeho denníky sa začnú čítať až počas Norimberského procesu po vojne.
Dňa 6. júna 1950 sa pred krajinským súdom v nemeckom Darmstadte overujú základné fakty z Gersteinových správ. Denacifikačný súd 17. augusta 1950 vyhlási Gersteina za nacistického zločinca. Gersteinova manželka s pomocou baróna von Ottera a ďalších významných priateľov dosiahne 20. januára 1955 omilostenie svojho manžela premiérom Bádenska-Wrttemberska.
