Cryoem: Metódy a protokoly

Pôvodný názov:

Cryoem: Methods and Protocols

Obsah knihy:

Časť I - Elektrónová kryotomografia

1. Začíname s in situ elektrónovou kryotomografiou.

Daniel Serwas a Karen M. Davies.

2. Kryoelektrónová tomografia a automatická segmentácia kultivovaných hipokampálnych neurónov.

Ryan K. Hylton, Victoria H. Seader a Matthew T. Swulius.

3. Praktické prístupy pre frézovanie kryo-FIB a aplikácie pre bunkovú kryoelektrónovú tomografiu.

Vinson Lam a Elizabeth Villa.

4. In situ zobrazovanie a určovanie štruktúry biomolekulárnych komplexov pomocou kryoelektrónovej tomografie.

Mohammed Kaplan, William J Nicolas, Wei Zhao, Stephen D Carter, Lauren Ann Metskas, Georges Chreifi, Debnath Ghosal a Grant J. Jensen.

Časť II- Analýza jednotlivých častíc a elektrónová kryomikroskopia

5. Pokrok na ceste ku kryoEM: Postupy s negatívnymi škvrnami pre biologické vzorky.

Shane Gonen.

6. Nastavenie paralelného osvetlenia na prístroji Talos Arctica na zber údajov s vysokým rozlíšením.

Mark A. Herzik, Jr.

7. Multi-body refinement of cryo-EM images in RELION (Viacnásobné spresňovanie kryoEM snímok v systéme RELION).

Takanori Nakane a Sjors H. W. Scheres.

8. Hodnotenie lokálneho a smerového rozlíšenia máp hustoty kryo-EM.

Sriram Aiyer, Cheng Zhang, Philp R. Baldwin a Dmitry Lyumkis.

9. Automatizované modelovanie a validácia proteínových komplexov v kryo-EM mapách.

Tristan Cragnolini, Aaron Sweeney a Maya Topf.

10. 2D elektrónová kryštalografia jedno-, dvoj- a viacvrstvových usporiadaných polí membránových proteínov.

Matthew C. Johnson, Yusuf M. Uddin, Kasahun Neselu a Ingeborg Schmidt-Krey.

Časť III-Elektrónová kryštalografia 2d kryštálov

11. Príprava vzoriek a zber údajov pre elektrónovokryštalografické štúdie štruktúr membránových proteínov a interakcie lipidov s proteínmi.

Ka-Yi Chan, Chloe Du Truong, Yu-Ping Poh a Po-Lin Chiu.

12. Analýza jednotlivých častíc pre 2D elektrónovú kryštalografiu s vysokým rozlíšením.

Ricardo Righetto a Henning Stahlberg.

13. Príprava vzoriek a zber údajov pre kryštály bielkovín v MicroED.

Guanhong Bu a Brent L. Nannenga.

ČASŤ IV - MIKROKRYŠTÁLOVÁ ELEKTRÓNOVÁ DIFRAKCIA (MICROED)

14. Detekcia mikrokryštálov pre kryoEM.

Simon Weiss, Sandra Vergara, Guowu Lin a Guillermo Calero.

15. Zber údajov pri nízkych dávkach a radiačné poškodenie v mikroED.

Johan Hattne.

16. Automatizácia zberu údajov pri kontinuálnej rotácii pre MicroED.

M. Jason de la Cruz.

17. Ab initio určovanie štruktúr peptidov pomocou MicroED.

Chih-Te Zee, Ambarneil Saha, Michael R. Sawaya a Jose A. Rodriguez.