Algoritmy v bioinformatike: Teória a implementácia

Recenzie čitateľov

Kniha poskytuje inovatívny a komplexný výklad bioinformatiky, ktorého autorom je autorita v tejto oblasti. Účinne zjednodušuje zložité koncepty a ukazuje jasné vzťahy medzi témami, vďaka čomu je vhodná pre pokročilých študentov a absolventov vysokých škôl.

Autor zrozumiteľne vysvetľuje zložité pojmy, komplexný materiál podáva zrozumiteľným spôsobom, preukazuje komplexné znalosti fylogenetiky a genomiky, obsahuje množstvo príkladov kódu a zachováva jasné oddelenie medzi názormi a faktami.

Kniha môže byť prínosnejšia pre čitateľov, ktorí sú už aspoň pokročilými začiatočníkmi v oblasti informatiky.

(na základe 1 čitateľských recenzií)

Pôvodný názov:

Algorithms in Bioinformatics: Theory and Implementation

Obsah knihy:

Algoritmy v bioinformatike: Teória a implementácia je stručná a zároveň komplexná učebnica bioinformatiky, ktorá opisuje niektoré z hlavných algoritmov, ktoré sa používajú na objasnenie biologických funkcií a vzťahov. Táto jedinečná príručka Algoritmy v bioinformatike pristupuje k predmetu v štyroch konvergentných líniách: matematika, implementácia, simulácia, experiment a môže byť ideálna pre vyššie ročníky vysokoškolského štúdia bioinformatiky, výskumníkov, doktorandov a sociológov alebo inžinierov poverených analýzou údajov.

Táto práca začína najprv všeobecným úvodom do biológie, ktorý má priniesť konkrétnejšie pochopenie molekulárnych procesov týkajúcich sa oblasti bioinformatiky. Po tomto úvode nasleduje podrobný pohľad na témy, ako je zarovnávanie sekvencií, vynútené zarovnávanie, detekcia motívov, sekvenčné logá, markovské reťazce alebo informačná entropia. Opísané sú aj ďalšie nové prístupy, ako napríklad samosekvenčné zarovnanie, objektívne digitálne škvrny (ODS) alebo spektrálna prognóza a algoritmus diskrétneho pravdepodobnostného detektora (DPD).

Táto práca obsahuje aj dôkladné postupné vysvetlenia týkajúce sa významu modelov pozadia v bioinformatike z viacerých hľadísk. Čo je však dôležitejšie, uvádza čitateľov do umenia algoritmov; ukazuje, ako navrhovať počítačové implementácie, a poskytuje rozsiahle pracovné príklady s podrobnými prípadovými štúdiami.

Implementácie, ktoré sú tu prezentované, poukazujú na to, ako môže natívne programovanie v javascripte rozšíriť obzory možností v bioinformatike zohľadnením možností moderných internetových prehliadačov. Na technické detaily o výpočtových algoritmoch sa používajú grafické ilustrácie, ktoré pomáhajú hlbšiemu pochopeniu ich vnútorného fungovania.

Okrem toho táto práca prináša čitateľovi do pozornosti viac ako 100 implementácií s otvoreným zdrojovým kódom a 33 powerpointových prezentácií.